上呼吸道感染只是描述感染的部位，具体是细菌感染还是病毒感染需要根据患者症状，或者辅助临床检查进行判断。如果是病毒感染，患者可能会有打喷嚏、流鼻涕、咳嗽等症状，多数是清水鼻涕，或者是比较黏的鼻涕，基本上没有黄鼻涕。如果患者出现黄鼻涕或黄痰，多数提示合并细菌感染。在实验室检查方面，患者可以查血常规，如果病毒感染，血象可能正常，或者白细胞水平有所降低。细菌感染的患者多数表现为中性粒细胞水平升高，多数提示合并细菌感染。
病毒感染和细菌感染的治疗不同，病毒感染的患者如果症状较轻，可以不进行干预，基本在7天左右则会自行好转。少部分患者症状较重，可以加用抗病毒的西药、中药感冒药。如果是细菌感染建议患者加用抗生素治疗，比如左氧氟沙星、阿奇霉素、大环内酯类药物、头孢类药物等。
