切口疝主要是因为先天性或者病理、生理性原因，造成腹壁组织未愈或者缺损，形成腹壁裂开状态。所以发病原因可能是先天因素，部分患者肚脐周围先天存在较薄弱的区域，而后天发育过程中，筋膜组织愈合不佳，甚至因为肥胖等多种原因，造成腹壁出现缺损。

以脐疝为例，脐疝是最容易发生的先天性切口疝，小儿哭闹造成在脐孔周围出现缺损，或者后天发育过程中一直没有愈合，会出现脐疝。病理原因最主要的是手术因素，手术后切口感染、切口缝合后未愈，可出现切口裂开，随着时间延长会形成切口疝。妇女生育过程中会造成筋膜、肌肉组织裂开，也是切口疝的一种类型。