系统性红斑狼疮是一种以致病性的自身抗体，以及免疫复合物形成并介导的多脏器受累的慢性自身免疫性疾病，目前发病机制以及病因并不非常明确，但是从总体上而言，通过多方面的临床研究，发现系统性红斑狼疮的发病，遗传因素起了一定的作用。

有资料研究表明，系统性红斑狼疮患者的第一代亲属中，系统性红斑狼疮患者的发病人数是正常人群的8倍以上。在临床上，系统性红斑狼疮患者的家族中，也常常会有其他免疫性疾病，如类风湿、干燥综合征等亲属存在。

并且多年的研究已经证明系统性红斑狼疮是多基因相关的疾病，与许多的人类白细胞抗原的缺陷有关。推测系统性红斑狼疮是由多个基因，在某些条件下相互作用，改变了机体的免疫耐受状态而导致疾病发生。

系统性红斑狼疮的发病是由很多的易感基因相互作用叠加产生，现在已经发现，相关的基因只能解释大概15%的遗传的可能性。环境因素也在系统性红斑狼疮的发病中，起非常重要的作用。