胆汁反流性胃炎临床表现不尽相同，所以治疗方法也不同。如果病人以胃脘胀满、脘腹疼痛、胃失和降为主要表现，可以应用胃苏颗粒、气滞胃痛冲剂等治疗。
若病人出现胆胃不和、胸脘痞闷、腹胀、纳差、口干、口苦、口黏、大便黏滞不爽、舌红、舌苔黄腻等，可以应用疏肝利胆的中药治疗，比如龙胆泻肝丸。
旧版龙胆泻肝丸中含有关木通和马兜铃酸，可能引起肾功能衰竭。新版龙胆泻肝丸通常不会引起肾功能衰竭。但服用时要注意中病即止，不要服用过多、时间过长，因为苦寒可以伤胃。
湿热中阻病人可以服用枫蓼肠胃康，肝郁脾虚病人可以服用逍遥丸，均可改善不适症状。
