鼻窦炎若手术比较规范，通常情况下不会有后遗症。但是可能理解方向不同，手术后鼻窦术腔出现粘连，这是最常见的并发症，与黏膜愈合能力、每个患者的伤口肿胀情况不同、手术操作有关。术腔粘连，比如中鼻甲处理不当出现漂移，漂移来回摆动容易出现术腔粘连，这时要尽量防止术腔的中鼻甲效应，尽量手术中间不要过度骚扰中鼻甲，不漂移就不易粘连。若一旦出现漂移，尽量防止因为漂移引起术腔粘连，这是最常见的并发症。
有些患者比较害怕，做鼻窦炎手术后出现空鼻症，空鼻症好多不是鼻腔里，而是在于大脑。实际上通过规范化治疗将病变组织切除，正常的解剖包括正常的黏膜保留后不会出现空鼻症。而且目前越来越注重对鼻腔、鼻窦黏膜，包括解剖结构的功能保留，因此，通常情况下不会出现也不可能出现，好多空鼻症是由于精神、心理出现障碍，从而出现这种情况。