慢性迁延性丙型病毒性肝炎的核心治疗是抗病毒对因治疗，现在只要HCV-RNA即丙肝病毒载量阳性，不管高低，如果患者有治疗意愿，一律应该接受抗病毒治疗。抗病毒治疗是既往一种比较成熟的治疗手段，即干扰素加利巴韦林治疗。后期干扰素经过聚乙二醇化变成长效干扰素，即长效干扰素加利巴韦林治疗，通过肌注、皮下注射给药。利巴韦林可以静注，也可以口服，可获得长期持续应答的40%-74%，即最多74%患者可以达到临床治愈。

随着科技发展，出现直接抗病毒的药物，包括蛋白酶合成抑制剂，可直接杀灭丙肝病毒，疗效超过原来的方法，治愈率可达到90%以上。但应该到正规医院进行专科治疗，直接抗病毒药物在使用之前要做相关检查和评估，包括丙肝基因型、是否合并其它疾病、肝功能状况、肾功状况等。也可以选择泛基因型药物，即所有基因型都可以用这种药物治疗，前提是在正规医院进行评估以后，选择这种药物治疗。