甲状腺过氧化物酶抗体的升高，不仅仅代表发生了桥本氏甲状腺炎，也可能发生一些其他的自身免疫性疾病，都可导致抗体的升高，比如皮肌炎、多发性肌炎、重症肌无力、斯蒂尔病、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、白塞氏综合征、干燥综合征。

甲状腺过氧化物酶抗体升高，提示机体产生了自身免疫性疾病，机体把甲状腺当做抗原，产生了针对甲状腺的自身抗体，一般是甲状腺过氧化物酶抗体升高、甲状腺微粒体抗体升高。机体发生自身免疫性疾病时，这些抗体都可以升高。

出现与自身免疫有关的疾病时，甲状腺过氧化物酶抗体都有可能升高，但是临床上见得比较多的还是桥本氏甲状腺炎。在桥本氏甲状腺炎时，由于自身免疫性疾病，患者出现抗体升高，多在体检时发现，如果没有出现甲状腺功能减退症时，一般不需要治疗，因为没有特别有效的药物来治疗抗体升高。

如果发生甲状腺功能减退症，给予左甲状腺激素替代治疗，一般是从小剂量开始，大多数患者都需要终身服药。