睾丸炎通常无法自愈，由于附睾炎累及到睾丸引起附睾睾丸炎，表现为较严重的阴囊肿痛，有时可能引起大腿根及后腰疼痛，在活动时疼痛加剧。此类炎症通常需进行抗感染治疗，无法自愈，如果不进行治疗可能症状会加重。常用治疗方法可使用抗生素治疗，在急性期症状较严重可静脉给予抗生素，比如头孢类抗生素。当急性期症状得到控制改善后，可改用口服抗生素继续治疗，才可较为彻底地治疗附睾炎及睾丸炎。当炎症得到控制或逐渐消退后，疼痛症状可得到缓解。

在临床上部分睾丸炎由腮腺炎病毒感染引起，称为病毒性睾丸炎，通常会表现为阴囊肿痛及严重高热。病毒感染通常需进行对症治疗，比如抗病毒、退热、增加身体抵抗力等。病毒炎性睾丸炎可逐渐自行好转，但后期可能会导致睾丸萎缩。