下肢动脉血栓需要与下肢静脉血栓以及其它疾病进行鉴别。血栓发生在静脉可导致静脉回流障碍，脚部出现红肿、疼痛。血栓发生在动脉会导致下肢血液供应失调，下肢动脉堵塞，远端肢体血供不足，所以，一旦发生下肢动脉硬化闭塞或急性栓塞，患者存在缺血症状，会出现远端肢体发凉、苍白、麻木、活动以后疼痛。

大部分患者初期容易与腰椎间盘突出混淆，因为腰椎间盘突出患者有时存在下肢麻木、活动后疼痛。鉴别方法为触摸拇趾与二趾，如果可以摸到动脉搏动，代表血管无异常；摸不到动脉搏动，同时存在明显肢体皮温低，有可能存在下肢动脉血栓，此时建议到附近正规医院进行血管彩超检查。