多潘立酮和莫沙必利的区别是药物成分不一样，作用机理也不一样，同时临床治疗的适应证也有一定的区别，具体如下：
1、多潘立酮：多潘立酮属于一种胃动力药，是一种外周多巴胺受体的阻滞剂，可以直接作用于胃肠壁，可以增加食道下部括约肌的张力，从而阻止胃食道反流。还可以增强肠蠕动、胃蠕动，促进胃的排空，协调胃和十二指肠的运动，并且能够抑制恶心、呕吐，并能有效地阻止胆汁反流，同时不影响胃液的分泌。所以主要适应证是用于治疗由于胃排空延缓、胃食道反流还有食道炎所引起的消化不良等症状，伴有上腹部的胀闷感、腹痛、腹胀、嗳气等；
2、莫沙比利：莫沙必利是一种选择性的5-羟色胺受体的激动剂，通过兴奋胃肠道的，胆碱能中间神经元，以及肌间神经丛的，5-羟色胺受体，从而能够促进，乙酰胆碱的释放，增强上消化道的运动，研究显示莫沙必利，具有促进胃和十二指肠的运动，加快胃排空的作用。所以莫沙必利主要用于改善，因为胃肠动力减弱所引起的消化道一系列症状，包括烧心、嗳气、恶心、呕吐、上腹痛等症状。
