目前检查以结肠镜为主，因为有时仅看一段肠道不能说明整体结直肠状况，所以目前大多数是做结肠镜，一次把结肠和直肠看完。
但是，部分病人只有直肠问题，可以做直肠镜检查，直肠镜对直肠炎可以诊断。如果是第一次检查，最好做结肠镜检查全面评估，防止对溃疡性结肠炎等病变的诊断不全。
直肠炎最主要是直肠刺激症状，比如下坠感或者直肠黏液增多、血便。如果光做直肠镜，看到范围比较有限，有时容易漏诊其它部位病变。