输卵管堵塞的原因很多，最常见的是输卵管炎症。输卵管位于女性的盆腔靠里的位置，一般不直接与外界相通，主要通过子宫的双侧角部与宫腔相通。因此，输卵管的炎症通常是阴道或子宫内膜的上行感染造成，比如间质部，可能会发生水肿或者粘连带，导致粘连变性或峡部堵塞。
如果患者做过人工流产，双侧宫角发生粘连，也会导致输卵管的开口的部位堵塞。如果患者是因为有盆腔的炎性疾病，比如以前患有化脓性阑尾炎，若脓肿播散，便可能播散到输卵管，导致输卵管靠外端的伞部发生炎性波及，导致伞部被堵住、闭锁，或可以观察到膜状的粘连带包裹。除炎性感染外，生殖系统的结核可能导致输卵管堵塞。
