胚胎自然流产常见原因如下：

1、自然流产最常见的原因是胚胎或胎儿染色体异常，包括染色体数目异常和结构异常。如果患有唐氏综合征，即第21号染色体上出现三体，可能引起出生后智力低下；

2、孕妇存在严重全身性疾病，如心衰、血栓性疾病；生殖道发育异常包括生殖道畸形、双角子宫畸形、子宫肌瘤；内分泌异常，比如高泌乳素血症、多囊卵巢综合征、甲状腺功能减退、血糖异常等均可导致自然流产；免疫功能异常，如狼疮、抗磷脂综合征等也可导致流产发生；

3、孕妇如果受到强烈的应激反应，如手术、强烈撞击、车祸、外伤以及吸烟、酗酒、吸食毒品均可引起流产；

4、父亲精子致畸率过高也可能导致自然流产；

5、环境因素也可导致流产，如核泄漏。