羊水穿刺需了解羊水穿刺的指征，如NT增高、21-三体高风险、唐筛。在腹部的探头所了解的羊水平淡处进行消毒、铺巾，旁开大约20cm。消毒后将探头套上无菌套，在超声探头的指引下，在腹部进行探测。在羊穿针的超声引导下穿过腹壁进入子宫，再进入羊膜腔。

羊穿针在羊膜腔内抽取羊水，为避免母体污染，前2mL羊水要弃掉。接下来再抽大约10mL或8mL分别做染色体的核型分析，培养胎儿的细胞做检测，或将羊水处理后做基因芯片的检查。手术抽完羊水后取出羊水针，做完羊水穿刺只需稍作休息就可正常生活。