作为整形手术，全耳再造谈不上危害，但作为比较复杂手术，有一定并发症。较明显并发症是在取材和做手术部位会有瘢痕，通过整形技术和防止瘢痕方法可以使瘢痕不明显。但只要是手术，仍会有瘢痕风险存在。

另外全耳再造需通过2-3次手术完成，且2-3次手术中至少有一次为全麻手术，所以有全麻手术风险。如果全耳再造做出来的耳廓远期发生碰撞、外伤、感染，可能会出现远期变形。因为再造耳廓和天生耳廓相比较娇气，所以护理不好情况下，有可能会合并出现手术远期感染。