原发性肝细胞癌门静脉癌栓的治疗方法如下：

1、对于门静脉分支癌栓，可以将癌栓和肿瘤一起切除，但是不能进行吸除；在原位直视下进行门静脉癌栓的切除，术后不容易发生播散；

2、如果门静脉癌栓不能通过手术切除，则可以选择其它的治疗方法，比如粒子种植；该项治疗属于局部的放疗，即通过门静脉穿刺将放射性粒子植入门静脉内进行放射治疗；此外，还可以选择体外的精准门静脉癌栓放疗、分子靶向治疗联合免疫治疗等。