卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，生理性囊肿如黄素化囊肿，黄体囊肿通常直径＜5cm的囊肿不影响怀孕，会随着月经周期变化消退，不影响怀孕。如果是病理性囊肿，包括巧克力囊肿、子宫内膜异位囊肿，这种囊肿影响怀孕。

如果囊肿直径＞10cm，建议先做手术把囊肿处理之后再怀孕。还有一些很大的囊肿、畸胎瘤或良性单纯的囊肿，如果很大，会影响排卵，怀孕期间会容易导致扭转，因为怀孕期间，如果发生卵巢囊肿扭转，处理会非常棘手。这种情况下也建议先手术处理，把囊肿处理之后再怀孕。