头孢克洛缓释胶囊和头孢克肟胶囊，都是头孢菌素类抗生素，都是通过与细菌细胞膜类的青霉素结合蛋白结合，抑制细菌细胞壁的生物合成，而发挥抗菌作用。二者主要有以下区别：

1、抗感染程度不同：头孢克洛缓释胶囊是第二代头孢菌素类抗生素，而头孢克肟胶囊是第三代头孢菌素类抗生素，都可用于敏感菌所致急性中耳炎、慢性支气管炎急性发作、急性支气管炎、单纯性尿路感染、皮肤软组织感染、泌尿生殖系统感染等。但临床上抗生素采用逐级应用原则，一般轻中度感染首选第二代的头孢菌素，如头孢克洛缓释胶囊、头孢呋辛酯片治疗。当感染更为严重时，采用第三代头孢菌素，如头孢克肟胶囊治疗，这样可以降低细菌耐药的发生。另外，头孢克肟胶囊还可用于猩红热的治疗，而头孢克洛缓释胶囊，一般不用于此病的治疗；

2、价格不同：由于生产厂家及制作工艺，以及规格的不同，头孢克洛缓释胶囊和头孢克肟胶囊的价格，会有一定的区别。一般头孢克肟胶囊的价格会略高一些。因此，患者可根据两者的特点，在医生指导下选择适合自己的药品。