在医学上子宫内膜异位囊肿，通常被百姓称为巧克力囊肿。实际上是在位子宫内膜，即在宫腔里的子宫内膜异位的一种表现形式，即子宫内膜因不明原因异常移位到卵巢上。

这种异位的子宫内膜仍然具有活性，并且在卵巢的周期性排卵和激素波动的刺激下，会发生周期性剥脱出血。由于没有流出的腔隙，无法像子宫内膜那样通过宫颈和阴道排出，即月经血，而是在卵巢内形成囊肿。

随着时间的推移，囊肿会增长，并且血液中的水分会被慢慢吸收，从而使囊腔内的液体变得黏稠，并且颜色加深，由于铁元素的析出，甚至变成褐色、黄褐色或黑褐色，类似巧克力。因此，被称为巧克力囊肿，实际上是一种卵巢行的子宫内膜异位症。

实际上是卵巢型子宫内膜异位症的一种良性疾病，有时候囊肿也可能恶变。随着囊肿的增大和不规则破裂的出现，一部分陈旧血液会流入盆腔，伴随子宫内膜细胞的脱落，从而可能导致盆腔子宫内膜异位症。

从长远来看，可能导致卵巢、输卵管和盆腔严重的粘连，并引起性交痛和不孕症。在个别情况下，子宫内膜异位囊肿也可能恶变。

因此，如果女性出现子宫内膜异位囊肿的症状，应及时就医并进行定期检查，必要时进行手术治疗。