菌血症一般是指细菌或真菌进入血液后在血液中繁殖所造成的全身炎症反应。

脓毒症是机体感染后更加强调此次感染所造成的器官功能障碍。脓毒症一般涵盖菌血症范畴，菌血症如果不及时治疗可以发展成为脓毒症。脓毒症一旦细菌或真菌入血后可以造成菌血症。所以菌血症更加强调清除原发感染灶。

脓毒症除需要清除原发感染灶更加强调器官功能支持。所以脓毒症和菌血症两者范畴和概念不同。菌血症和脓毒症都会引起全身炎症反应，所以菌血症和脓毒症在临床当中需要进行鉴别。