口腔囊肿可能会发生癌变，但癌变率极低，癌变率通常为0.01%-0.02%，所以只要把牙龈囊肿摘除干净即可。如果摘除不干净，或摘除以后又复发，这种情况下则需提高警惕，以防癌变的发生。

牙龈囊肿分儿童牙龈囊肿和成人牙龈囊肿，儿童牙龈囊肿通常无需处理，长大后可自行消失。成人牙龈囊肿需采取手术治疗，将囊肿整个摘除。