绝大多数甲状腺功能亢进的患者，应该到内分泌科就诊，因为甲状腺功能亢进症，主要表现为甲状腺激素紊乱，而导致体内一系列的代谢紊乱综合征，内分泌科可以进行药物治疗，给予筛查、诊断以及调整药物。如果甲状腺功能亢进合并其他并发症，其他科室可能要与内分泌科进行多学科合作，具体科室如下：

1、普通外科：如果合并有甲状腺结节，或者甲状腺本身有问题，胸骨后甲状腺肿，需要通过手术的方法治疗甲状腺功能亢进，这个时候需要普外科的帮助。内科医生做好手术前的准备，术后进行评估和替代治疗；

2、血液科：甲状腺功能亢进患者可能会出现造血系统功能障碍，出现贫血、白细胞减少等症状，在吃甲状腺功能亢进药物时，也会影响血常规。此时应该到相应的血液科就诊，排除血液系统疾病，同时使用升白细胞的药物；

3、核医学科：如果不适合药物治疗，或者手术治疗，甲状腺功能亢进可以进行碘-131治疗，应该在核医学科进行；

4、其他：如果甲状腺功能亢进患者，出现肝损伤等，可以到肝病科、消化科，排除本身的肝脏疾病，进行相应的治疗。