甲亢患者就诊科室需根据患者的病情，以及治疗需求来决定。如果甲亢患者尚未诊断，一般在内科进行诊断，在较小的医院可就诊于普通内科，在三级甲等医院，可到内分泌科进行诊断，部分医院划分较细，可到甲状腺科进行诊断。如果甲亢患者已经诊断，需要在内科进行药物治疗。
药物治疗的方法非常简便，各级医院都可以开展，但其弊端是治疗时间长、复发率高。如果采用核素碘-131，治疗弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症，需就诊于核医学科，该科室只在三级以上的医院设有。核素碘-131治疗属于精准性、靶向性治疗，患者治愈率高，复发率低。如果甲亢患者想用手术方法进行甲亢的治疗，就需要挂外科，也可挂颈部外科。
所以根据患者治疗的情况，可选择不同的科室进行诊治。一般来说，甲亢的治疗方法，要根据患者的临床表现进行综合评定。
