无排卵性功能失调性子宫出血的治疗原则是止血、调整周期，有生育要求的患者促排卵。青春期少女以止血、调整周期为主；生育期的女性以止血、调整周期、促排卵为主；围绝经期的女性以止血、调整周期、防止内膜癌变为主。
出血时首先要止血，少量阴道流血的无排卵异常子宫出血，B超显示患者的内膜相对较厚，可以连续用孕激素，停药以后3-7天就会有撤退性的出血，出血量多的患者需要快速止血，特别是围绝经期的女性建议首选诊刮止血。
药物治疗可以用较大剂量的口服避孕血止以后再逐渐减药，青春期功血需要用大剂量的雌激素口服止血，通常止血以后也是逐渐减药，然后是调整周期。对于体内有一定雌激素水平的患者可以用孕激素定期撤退出血，有避孕要求的患者可以用短效口服避孕药。青春期少女用雌孕激素序贯治疗，有生育要求的患者可以考虑促排卵治疗。
