果酸和水杨酸的区别在于分子式不同，两者结构上的不同导致临床应用存在偏向性，具体区别如下：

1、果酸：是一种水溶性酸，可深达真皮层并刺激胶原再生，有角质剥脱和一定抗衰老的作用，还可剥脱浅表色斑，起到一定的淡斑作用，同时可提亮肤色并有效美白；

2、水杨酸：是一种脂溶性酸，相对果酸能更加有效地深入毛孔，起到清洁毛孔的作用。其作用主要体现在抗炎方面，能有效深入毛囊，调节毛囊上皮角质形成细胞，减少其异常角化。同时还可调节毛囊微环境，起到抗菌、抗炎的作用。故通常首选用于治疗痤疮，即青春痘，尤其是中重度痤疮。

所以水杨酸相对果酸，其淡化色斑或抗衰老的作用稍弱，更重要的是有抗炎作用。