金莲花胶囊的成分为中药的金莲花，所以在临床使用时，可以作为金莲花单味药入方剂，配合中草药一起使用。也可以作为清热解毒的药，和其他中成药配伍，有利于抵抗外界病原体。现代研究对这些中草药的新发现是可以代替中药有抑菌或者抗病原体的成分使用，就类似以前用板蓝根、鱼腥草这类药。

在使用此药物时应注意，此药属寒，能清肺胃经的热，也能清肝经的热。长期使用寒性药物，对脾胃有一定影响，所以很少单用这味药，应与其他中草药相互配合使用。

中医用药讲究配伍，君臣佐使要相互配合，这是最重要的一点。不是有热就拿清热的，是肝病拿治肝的茵陈，是肺炎就加鱼腥草，而是将人作为整体来进行辨证，寒热、阴阳、虚实、表里，通过辨证后，共同组成方剂来治疗疾病，金莲花只是作为其中一个成分。