药物流产后的疼痛时间因人而异，多数女性可能疼痛2-3个小时。药物流产需口服3天药物，第1天、第2天服用米非司酮等孕激素拮抗剂，通常无明显反应。

第3天需使用米索前列醇，以帮助子宫收缩、扩张宫颈，通常服用米索前列醇后多数女性可以发生疼痛感，疼痛时间因人而异。多数女性在服药后的2-3小时出现疼痛，随着胚胎排出，疼痛程度可能逐渐减轻。对药物较敏感的女性，可能疼痛不到1个小时便可以排出胚胎，但部分女性对药物敏感度相对低，疼痛时间可能延长，可能持续在4-5个小时。

每个女性进行药物流产的疼痛时间，以及严重程度，存在较大的个体差异性。建议疼痛较明显的女性，进行密切观察，同时注意阴道出血量，如果出血量多于月经量，也需及时找医生求助，进行相应处理。