磺胺嘧啶是抗菌药物，属于磺胺类抗菌药物，发挥抗菌活性主要是作用于病原菌叶酸的合成过程，可以抑制叶酸合成和代谢过程中关键的酶，起到干扰病原菌叶酸合成和利用的功效，从而干扰病原菌DNA遗传物质的合成，起到抑制繁殖的作用。
磺胺嘧啶对多种病原菌都具有一定的抗菌活性，比如金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、肺炎链球菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、志贺菌、沙门菌。在临床上，磺胺嘧啶主要可以用于多个部位的感染，但是因为磺胺嘧啶的耐药性逐渐上升，所以一般只用于药敏结果显示对其敏感的病菌。
磺胺嘧啶目前首选用于脑膜炎相关的感染，也可以用于努卡氏菌的感染性疾病，磺胺嘧啶通常和甲氧苄啶组成复方制剂，用于感染性疾病的治疗，可以起到协同抗菌的作用。
