雌激素和孕激素主要区别在于分泌时间、生理功能不同等，具体如下：

一、分泌时间不同：雌激素水平在排卵前迅速增长，孕激素在排卵以后才开始分泌，黄体成熟时孕激素达到高峰；

二、生理功能不同：1、雌激素，可促进子宫内膜增长，促进子宫发育，还可促进水钠潴留，引起身体水肿。2、孕激素，可降低子宫平滑肌张力、兴奋性，抑制子宫收缩，具有保胎、促进胚胎生长发育、孕卵着床、水钠排泄的作用，还可以使子宫内膜由增生期转为分泌期，为受精卵着床作准备。

雌、孕激素均作为卵巢分泌甾体激素，呈周期性分泌。周期性变化主要作用于子宫内膜，使其呈现增生期、分泌期改变，促进月经来潮。孕激素在雌激素作用基础上可以促进女性生殖器官、乳房发育，为妊娠做准备。