HLA-B27阴性代表机体并不表达HLA-B27基因，HLA-B27代表的是人类癌细胞抗原B27的简称。HLA-B27这个基因属于一型主要组织相容复合体基因，这个基因基本上表达机体所有的有核细胞上，尤其是在淋巴细胞表面。

HLA-B27的表达和强直性脊柱炎有密切关系，在强直性脊柱炎患者当中，90%左右的患者HLA-B27为阳性，在一般人群当中，HLA阳性的患者患强直性脊柱炎的几率要比阴性的人群明显的增加，也就是HLA-B27如果阴性，其患强直性脊柱炎的可能性会明显下降。

目前已经发现HLA-B27有很多的亚型，而和强直性脊柱炎相关的主要是HLA-B2704，和HLA-B2705，HLA-B27阳性的健康者和强直性脊柱炎患者可能有一些遗传差异，所以HLA-B27阳性的患者，仅代表遗传和表达的基因，并不一定就说明患有强直性脊柱炎。

同样对于HLA-B27阴性的人群，并不是代表就不会得强直性脊柱炎这个疾病，也有可能存在一些，HLA-B27阴性的强直性脊柱炎人群。