核磁共振不但可以明确骶髂关节炎，还可以发现以骨髓水肿为表现的最早期的骶髂关节炎。骶髂关节炎常见于强直性脊柱炎或者脊柱关节炎，部分强直性脊柱炎患者最早期的表现便是骶髂关节改变。因此，在诊断强直性脊柱炎或者脊柱关节炎，或者明确疾病的病程进展、发病速度时，需要评估骶髂关节情况，而核磁共振便可有效明确骶髂关节炎进展情况。尤其是在疾病发展的早期，X光片、CT均无法发现骶髂关节炎，需要借助核磁共振辅助诊断。
对于骶髂关节炎患者或者疑似强直性脊柱炎、脊柱关节患者而言，早期进行X光片、CT检查，无法明确骶髂关节炎，可以考虑进行骶髂关节的核磁共振检查，便于早期发现、早期诊断、早期治疗，可避免最终出现从X光片或者CT可以观察到的骶髂关节融合等改变。
