杞菊地黄丸和明目地黄丸在临床上要注意区别使用，因为药物组成不同，临床疗效也有一定区别，具体如下：

1、杞菊地黄丸：是在六味地黄丸的基础上，加了枸杞子和菊花两味药而制成，所以药物组成包括熟地黄、山茱萸、山药、泽泻、牡丹皮、茯苓、枸杞和菊花。功效与作用是滋养肝肾，主要用于治疗肝肾不足、阴血亏虚所导致的眩晕，原发性高血压见上述证候者，还可用于治疗耳鸣、耳聋、目涩畏光以及干眼症所导致的视物昏花等症状；

2、明目地黄丸：是在六味地黄丸的基础上，增加了枸杞子、菊花、当归、白芍、蒺藜和石决明等成分，所以药物组成较复杂。主要的功效与作用是滋肾、养肝、明目，用于治疗肝肾阴虚所导致的目涩畏光、视物模糊、迎风流泪等症状，中老年人视瞻昏渺，出现眼外观不异于常人，由于年老体衰、经血不足，导致眼泪失约、迎风流泪等症状，可以用明目地黄丸来治疗。