基因突变，在目前的技术水平情况下，通常不能够治疗。基因突变常常是胚胎在发育过程中，由于致畸因素的作用，从而导致染色体或者基因突变出现的一组临床上相关的疾病，是遗传物质的改变，通常不能够治疗。
比如临床常见的21-三体综合征，是21号染色体出现三体，孩子临床会出现智力低下、运动发育落后、特殊面容等临床表现，一般无法根治，只能通过后期的康复训练等进行改善；还有比如血友病，也是由于基因突变导致凝血因子异常，通常只能通过后天输注凝血因子来改善出血倾向，而不能彻底治愈。
如果夫妻曾经分娩过存在着基因缺陷的孩子，可以做产前咨询，做双方的基因测定，可以通过第三代的试管婴儿技术，筛选不存在突变基因的胚胎，然后植入体内，保证可以分娩正常的婴儿，从而避免基因突变的疾病发生。这个在目前可以做到，避免一些基因突变的疾病，可以用到这样的技术。
