BNP半衰期指血中BNP耗时将其中一半从血液中代谢排出，实际只有22分钟，时间较短。心力衰竭病人心房、心室，由于压力负荷过重之后，可以分泌出BNP，于血液中存在的时间与半衰期长短有直接关系。半衰期短在血液存在的时间也较短，指半衰期短的物质在血液内检测，不一定能反映真实水平。BNP是用来诊断与评估有无心衰以及心衰严重程度的指标，在症状发作后的不同时间段内，测量BNP可能差异较大。

由于BNP半衰期时间比较短，隔几个小时检测血液的BNP差异较大，所以在BNP的基础上又找出被称为NT-proBNP的指标。NT-proBNP是BNP生成过程中，与其1:1比例产生的物质，NT-proBNP的半衰期比较长，是BNP的几倍。目前用半衰期较长的NT-proBNP作为检测指标，对于心力衰竭严重程度的评估比BNP更加准确。