新生儿脑积水原因较多，主要包括以下几点：

1、大部分与儿童在母亲体内时出现疾病相关，如儿童在母亲体内时曾经出现过颅内出血，或因为外伤或产伤导致在生产过程中颅内出血；

2、部分儿童是因为维生素缺乏，尤其维生素K1缺乏，此类儿童出生时需注射维生素K1，避免之后继发颅内出血，导致脑积水发生；

3、部分脑积水发生是由于儿童在母亲体内时发生过感染，包括常见病毒感染、细菌或支原体、衣原体感染；

4、部分新生儿脑积水是由于基因突变或有遗传性疾病，在母体内时即可查出，四维彩超、磁共振检查可发现儿童脑室扩大。此类脑积水常伴有基因缺陷，会引起较严重的神经功能障碍，需要早期进行治疗或在产前进行基因筛查，如羊水穿刺检查，尽早排除基因遗传疾病导致的神经系统功能障碍。