支气管肺泡灌洗属于一种手术操作，多数手术以全肺灌洗比较多见，一般情况并发症很少。假如做全肺灌洗，或者时间比较长的灌洗，可能会有一定并发症发生，支气管肺泡灌洗的常见并发症具体如下：

1、低氧血症，在支气管肺泡灌洗时要给予吸氧，包括灌洗后需要高频通气供氧。部分患者可能要给予高浓度氧，尽可能保持气道压力高于肺动脉压，且需要检测动脉血气；

2、因为做肺泡灌洗时，肺泡里打水后可使肺活量减少，灌注24小时以内通常不能全部吸收，部分患者可能会出现一定程度肺不张；

3、引起一定程度的肺不张、血压下降、液气胸、支气管痉挛；

4、引起肺部感染、肺炎，可能由操作未严格无菌所致，少部分患者可能因出现肺炎导致。