真菌性尿道炎要吃抗真菌的药物，如特比萘芬、氟康唑等，但此类药物通常副作用较大，会损伤肝功能。若肝脏功能不佳，或肝功能正常但长期服用此类药物的患者，需定期检测肝功能。同时服用药物期间，应尽量多饮水以冲刷尿道。

同时结合部分利尿、清热、解毒的中成药，如银花泌炎灵片、三金片等，帮助治疗真菌性尿道炎。在治疗期间需要多饮水，保证尿量充足，可以摄入利尿的水果和蔬菜，如冬瓜、西瓜等。另外要保证会阴部的清洁、卫生和干燥，有利于治疗真菌性阴道炎。