肛瘘为感染性的瘘管管道，一旦形成即不能自愈。多数患者都抱有保守治疗的想法，但是肛瘘目前只有手术，唯一的治疗途径。因为肛瘘形成以后，不断有粪便、肠道分泌物等污染物进入瘘管内，反复的刺激引起瘘管纤维化增生，使用药物只能控制炎症，但是不能起到清除瘘管、根除肛瘘的目的。只有通过手术的办法去除瘘管，处理感染灶才是目前治疗肛瘘唯一有效的方法。