患者肛门疼痛时，一般要依据疼痛的原因不同，使用药的种类也会有所区别：
1、皮脂腺囊肿：建议患者采用如意金黄膏或者0.5%的活力碘湿纱布持续外敷，每次敷的时间至少在15-20分钟左右。通过局部的外敷，可以使病情较轻的皮脂腺囊肿并感染自行吸收，取得较好的效果。如果患者局部皮脂腺囊肿感染较严重，此时单纯使用药物的治疗效果不佳，可以行脓肿切开引流，清除局部的坏死组织，从而可以较快的减轻炎症，改善疼痛症状；
2、痔疮：也可造成肛周的疼痛症状，尤其是血栓性外痔，发生较严重的痔核脱出、肛周水肿，痔核不能还纳入肛门内。一般可以使用复方黄柏液进行温水坐浴，改善局部的血液循环，减轻组织水肿，可以通过外擦龙珠软膏、马应龙痔疮膏、太宁栓和牛黄痔清栓等药物，减轻患者的疼痛。如果疼痛仍然无法改善，也可以考虑手术治疗。
