甲状腺功能减退的原因比较多，有些是不可逆的原因，有些是可逆的原因，如甲状腺炎、亚急性甲状腺炎所导致的甲状腺功能减退，随着炎症控制，甲状腺细胞功能可以逐渐恢复，甲状腺功能减退也可以完全恢复。但是大多数甲状腺功能减退是不可逆性原因所导致，如桥本氏甲状腺炎导致的甲状腺细胞的破坏，131碘治疗或者手术治疗导致甲状腺细胞的破坏，这种甲状腺功能减退往往需要长期的终身的甲状腺激素替代，尽管甲状腺激素替代以后甲状腺功能可以维持正常，但是激素替代一旦停止以后，甲状腺激素又会出现不足的表现。
因为这种治疗方式并不是针对病因的治疗，而只是给予激素进行补充的替代治疗，因此对于大多数甲状腺功能减退的患者，激素替代治疗可以让甲状腺功能完全正常，生活状态和正常人也是毫无二样的，但是不能够减少激素或者停止激素的用量，一旦停止激素的使用又会出现甲状腺功能减退相关的症状。
