半夜醒来心跳加速是交感神经兴奋导致。人体正常是白天交感神经兴奋，晚上是迷走神经兴奋，但是半夜醒来突然植物神经紊乱的情况下，可以出现心动过速反应。

此外，有基础疾病的患者，如甲亢，也可以出现心动过速的表现，其它的心脏疾病，如有冠心病的情况下，可能也会有心跳加快的情况。如果心跳加速在休息之后没有明显缓解，要及时到医院就诊。