手足口病有疫苗，但是手足口病疫苗主要是针对临床上症状最重、死亡率最高的EV71肠道病毒，手足口病只针对这一型有效。EV71肠道病毒引起的手足口病危重症发生率比较高，大部分的死亡病例都是由EV71肠道病毒引起，以减少重症病例的发生，减少死亡病例的发生。
打了手足口病疫苗之后，对此类型的病毒有防御作用、免疫效果，但是手足口病不只是EV71肠道病毒引起，有20多种肠道病毒可以引起手足口病的发生。打了手足口病疫苗之后，对EV71肠道病毒有免疫效果。如果是有别的型引起的手足口病，依然没有免疫防御作用。
所以，即使打了此类型的疫苗，如果感染的是别的型病毒，可能还是会发生手足口病。但其是对最重要的一型肠道病毒的防御，如果感染别的型的手足口病，临床上病情会相对较轻，重症发生率会较少。
因此，手足口病疫苗虽然不能预防所有类型的手足口病发生，但是对于适龄儿童还是要积极地去接种。
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