临床上最常见的原发性肺炎是各种外界病原菌引起的呼吸道感染的肺炎。即常见说的细菌性肺炎或病毒性肺炎。首先要分清楚是病毒性或细菌性，如果是病毒性肺炎，通常要抗病毒治疗。目前抗病毒肺炎治疗药物有奥司他韦、阿比多尔。如果是细菌性肺炎，需针对相应的病原菌，使用对应的抗生素治疗。

临床最常见的肺炎链球菌引起的肺炎，可以使用青霉素类、二代头孢类、大环内酯类药物，针对原发性肺炎进行治疗。