小儿尿道下裂主要是根据手术之前形态，或者手术中阴茎伸直后形态进行分类，现在按照手术之前形态进行分类比较多，可以分为远端型、中间型以及后端型。所谓远端型，是尿道开口在阴茎头、冠状沟以及冠状沟下型。

如果开口在阴茎中段，称为中间型。如开口在根部、阴囊或者会阴部，就称之为后端型。尿道开口越靠近会阴，预示伴发的畸形会越严重，手术难度越大，分裂越靠近阴茎根部，越会伴发有阴茎下弯，又会伴有前列腺囊以及阴茎发育问题，手术难度、手术分类、手术技巧要求更高。