沙眼衣原体是新生儿结膜炎的常见病原菌，对于新生儿结膜炎的病原，沙眼衣原体居于首位，占10%-74%，远远高于淋球菌，且还可以导致沙眼的发生。
沙眼衣原体是一种革兰阴性细菌，缺少合成高能物质（如ATP）的酶系统，为专性上皮细胞内寄生的原核细胞型微生物。沙眼衣原体是衣原体属中与人类最密切的病原体，易侵犯泌尿道及生殖道上皮。沙眼衣原体分为15个亚型，亚型D～K可引起生殖道和眼部感染；D-K、Da、Ia等10个血清型引起新生儿结膜炎。沙眼衣原体广泛存在于空气、皮肤及患者的分泌物中，其通过多种不同的途径传播。尤其是患沙眼者常有眼红和黏性分泌物，有时还有流涕，而分泌物中含有的沙眼病原微生物很容易传播至手指、衣物、毛巾、洗脸用具或其他所接触物品，当人们紧密接触时，沙眼衣原体易通过交互接触而传播。所以可造成重复感染，从而增加沙眼炎症的严重程度。
