羊水穿刺不能完全排除胎儿畸形。羊水穿刺是医生通过超声波的监控，用细长的穿刺针依次穿过腹壁、子宫肌层和羊膜，抽取约20毫升的羊水，主要检查其中胎儿的染色体。

羊水穿刺检查的主要目的是明确胎儿是否存在染色体异常。染色体异常可以导致胎儿畸形，出现大脑、神经、心脏等发育畸形。但胎儿畸形的原因不仅只有染色体方面的问题，也包括基因、母体因素、环境因素及双亲遗传因素等，因此羊水穿刺并不能完全排除胎儿畸形。

羊水穿刺只是排除胎儿畸形的检查方法之一，除此之外，还可做四维彩超检查。四维彩超可观察到胎儿在母体里的状态，对胎儿四肢畸形、心血管畸形等能够做出早期诊断。

怀孕期间为预防胎儿畸形，孕妇要增加营养，建议食用富含优质蛋白、维生素、高钙的食物，如牛奶、绿叶蔬菜、豆类食品等。除此之外，孕妇也应注意休息，不宜过度疲劳，按时产检，发现身体不适，及时去医院。