马尔堡病毒是一种严重的具有传染性的致病性病毒，被感染者只要血液含有此病毒，就一直具有传染性。
世卫组织研究表明，马尔堡病毒的传播最初是由空气传播或者接触传播，由于人类接触了马尔堡病毒感染的北非果蝠群落栖息矿山或者洞穴，而健康人群又通过破损的皮肤或黏膜密切接触到已感染者的血液、体液，包括眼泪、唾液、汗液、尿液、粪便和母乳、痰液以及器官等被感染，通过这一系列途径造成人与人之间的传播。比如卫生保健工作人员在救治疑似或已确诊的马尔堡病人期间，因没有采用严格的感染防护措施，与病人发生接触，造成感染；或因被污染的注射器械、针头等扎伤造成病毒传播。
为妥善控制病毒传播，应采取病例管理、接触者监测和追踪、良好的实验室服务等一系列干预措施。社区参与是成功控制疫情的关键，提高人们对马尔堡病毒感染风险因素以及个人保护措施的认识。在社区减少由于直接接触或者密切接触感染患者，而出现的人与人传播风险；避免与马尔堡患者发生身体上的密切接触；照护病人时应当戴上手套和个人防护装备，并例行消毒洗手；受到马尔堡影响的社区应当采取措施，识别可能与马尔堡病毒感染者接触过的人，并监测其21天的健康状况，将健康者与患者分开以防进一步传播，同时保持良好的卫生条件和清洁的环境。