亚麻籽粉为亚麻的种子加工而成的食品，长期喝亚麻籽粉可能会导致消化不良等胃肠吸收功能方面的异常。此外亚麻籽粉中的一些成分对心血管系统、激素水平等还有一定的副作用，所以不建议长期大量喝。

1、影响消化系统：亚麻籽粉含有丰富的膳食纤维，长期大量喝会增加胃肠道负担，患者可出现腹胀、便秘、腹泻等症状；

2、影响心血管系统：亚麻籽粉里的生氰糖苷还有对抗维生素B6等作用，如果维生素B6水平下降，患者发生心脑血管疾病的风险会增加；而且亚麻籽粉内还含有不饱和脂肪酸等成分，具有一定的抗凝作用，所以有凝血问题或服用抗凝药物的患者应该进行专业咨询后再决定是否要吃亚麻籽粉；

3、中毒：生的亚麻籽粉里的生氰糖苷可以在人体内分解为氰化物，而氰化物是有毒成分，大量吃会在体内蓄积过多，有中毒的风险；熟的亚麻籽粉中虽然生氰糖苷含量大大降低，但是长期过量饮用依然会有一定的中毒风险，因此喝亚麻籽粉建议选择合格的产品熟透后喝，不要大量喝；

4、其他副作用：亚麻籽粉属于高能量密度食物，故长期服用可能导致肥胖。