酵素果冻本身属于食物，因此在适量食用的情况下不存在副作用的说法。减肥或者经常便秘的人群可以适当食用可以促进胃肠道蠕动，帮助消化。但需注意，由于缺乏明确的生产规范，个别商家生产的酵素果冻可能存在泻药、香精色素添加过量的情况。无论何种酵素果冻，也都不能作为代餐食用，长期不当食用可能影响消化功能或对身体产生营养、代谢危害，甚至因食用不当引发意外。

1、影响消化功能：一部分酵素果冻会添加一些酵素、番泻叶等成分，过量的番泻叶可以导致腹泻。本身肠道虚弱或者慢性腹泻的人群，在食用酵素果冻后可能会加重腹痛、腹泻等症状。在番泻叶摄入过多增强腹泻后，可能使体重在一定程度上得到减轻，但长期食用可能造成胃肠道敏感，影响身体消化功能，也无法达到健康减肥的目的；

2、误食窒息：酵素果冻食用不当时，有可能卡住呼吸道引起窒息危险，尤其是做成果冻后容易被小孩子误食，加重了此类风险的发生；

3、营养不良：酵素果冻一般仅作为零食食用，不能代替日常进食。如果长期不吃饭，用酵素果冻代替，可能导致营养不良，甚至发生贫血等疾病；

4、新陈代谢紊乱：长期食用酵素果冻可能造成肠道吸收能力下降，导致人体新陈代谢发生紊乱，影响人体其他组织器官的正常功能。