腰部要进行核磁共振检查应该挂骨科进行诊疗。如果在三甲的综合医院分科非常详尽，要挂脊柱外科进行诊疗，医生会通过询问病史、查体来判断是否需要进行磁共振检查。

如果患者确实具备进行磁共振检查的适应症，医生会出相应的检查申请单，患者拿着申请单进行缴费检查，出结果以后再由医生进行相应的诊断和治疗。

有些疾病下腰部要做磁共振可以挂神经外科，比如脊索瘤，这种肿瘤是属于神经组织肿瘤，也是神经外科的诊疗范畴，也可以挂神经外科对脊索瘤进行磁共振的检查。